2023年まで14年連続でサンマの水揚げ量日本一になっている北海道根室市の花咲港。その花咲港漁協関係者によると、近年は不漁が続いていたが一転、９月25日は１日の水揚げ量が５年ぶりに１日1,000トン近くになる見込みだという。
同日、花咲港には13隻のサンマ漁船が入港して午前２時ごろから水揚げが始まり、クレーンで岸壁のトラックに次々に移されていた。

国際体操連盟（FIG）の渡辺守成会長が９月24日、2025年３月の国際オリンピック委員会（IOC）会長選挙に日本から初めて立候補した経緯や抱負を語った。東京都内で記者会見した渡辺氏は、FIG会長として160カ国以上を訪問して現場の意見を聴き取って来た経験を挙げ、「トップダウンでなく、ボトムアップの五輪をつくっていきたい」と所信を述べた。そして、「決して楽な戦いではないが、精一杯、努力して国内でのスポーツのプレゼンス、世界における日本のプレゼンスを上げるために、少しでも貢献できればと思う」と語った。

静岡地裁は９月26日、1966年に静岡県で一家４人が殺害された事件で死刑が確定した袴田巌さん（88）のやり直し（再審）で、無罪判決を言い渡した。同地裁は証拠について、「３件の捏造がある」と認めた。
確定死刑囚の再審無罪は「島田事件」以来35年ぶりで、戦後５例目となる。検察側が控訴しなければ事件から58年を経て、袴田さんの無罪が確定する。これまでの４例は検察が控訴せず確定した。

兵庫県の斎藤元彦知事は９月26日、県議会を解散せずに９月30日付で自動失職したうえで、出直しの知事選に再度立候補する考えを表明した。斎藤氏は「改革を進めていきたい」と述べ、強い続投意欲を示した。そのうえで、県政に混乱を招いた責任を認めつつ、不信任決議に対しては「知事が職を辞すべきことなのか」と疑問を呈し、「自ら辞職することは考えていなかった」と説明した。

日本相撲協会は９月25日、両国国技館で大相撲九州場所（11月10日初日、福岡国際センター）の番付編成会議と臨時理事会を開き、西関脇大の里（24、本名：中村泰輝、石川県出身、二所ノ関部屋）の大関昇進を満場一致で決めた。初土俵から所要９場所の昇進は昭和以降最速。新入幕から所要５場所も、年６場所となった1958年以降新入幕では大横綱・大鵬の６場所を抜いて最速。
大の里は相撲協会の使者に「唯一無二の力士を目指し、相撲道に精進します」との口上を述べた。

2025年大阪・関西万博の開幕まで９月25日で200日となった。同日、前売り入場券の「超早割１日券」（大人6,000円）を対象とした来場日時などの予約が始まった。大阪・関西万博は「並ばない万博」を掲げ、混雑を避けるため原則として来場日時を予約する必要がある。予約制を導入するパビリオンやイベントでは、別に予約の手続きが必要になる。
超早割１日券は10月６日まで販売され、同日までに専用サイトで来場日時などの予約申し込みができる。枠が埋まれば抽選になり、結果は10月７〜12日に発表される。

国立感染症研究所のまとめによると、９月15日までの１週間に調査の対象となっている全国およそ3,000の医療機関から報告された「手足口病」の患者数は、速報値で２万5,143人だった。
１医療機関当たり8.03人と、この時期としては過去10年で最も多く、全国36の都道府県で国の基準の５人を超えて警報レベルとなっている。とりわけ患者数の多いのが関東地区。神奈川県を筆頭に埼玉、東京、千葉、栃木、茨城、群馬の１都６県は目立って警報レベルを上回っている。
手足口病は夏場に主に子どもが感染し、手、足、口の中などに水ぶくれのような発疹ができるウイルス性の感染症。まれに脳炎などを起こして重症化することもある。

福岡県は９月24日、プロ野球、福岡ソフトバンクホークスが今後のクライマックスシリーズや日本シリーズを制覇した場合、県内の経済効果は447億円に上るとの試算を発表した。
リーグ優勝から一夜明けた同日、大丸福岡天神店（所在地：福岡市）が同日から３日間の「優勝おめでとうセール」を始めたほか、福岡県内の百貨店や商業施設では記念セールを開始した。

上川陽子外相は９月23日（日本時間24日）、ニューヨークで開催されている国連総会に合わせ同様に滞在中の中国の王毅外相と会談した。上川外相は中国広東省深圳市で日本人学校に登校中の男児が刺殺された事件を受け、早急に事実関係を解明し、明確に解明するよう改めて求めるとともに、現地の日本人の安全を確保するための具体的な措置を講じるよう要請した。このほか、SNS上の悪質な反日的な感情を煽る様々な投稿の取り締まりを徹底することも促した。
中国は深圳市の男児刺殺事件について、様々な反日的活動のあらわれの一環などとの指摘もある中、「あくまでも偶発的な個別事件で、法律に則り処理する」とのコメントに終始している。

記録的豪雨となった石川県能登地方では、元日の地震に続いて土砂災害に見舞われ、各地で道路が寸断や断水が起きるなどインフラ被害が広がっている。これにより孤立集落が相次ぎ、一時は100カ所を超えたが、９月23日午後３時時点でも56の集落が孤立状態にある。また９月23日午後４時現在、死者７人（輪島市６人、珠洲市１人）、行方不明２人、安否不明４人などとなっている。このほか、県などによると避難している人は輪島市で536人、珠洲市で92人など計632人に上っている。