10月１日に制度が変わる。酒税の改正でビール系飲料の税率が一つに統合される。ビール、発泡酒、第三のビールの税率は350㍉㍑あたり54.2円に統一される。その結果、ビールは9.1円の減税、発泡酒と第三のビールは7.26円の増税となる。

総務省は９月29日、2025年10月１日時点の2025年の国勢調査の確定値を公表した。2020年の前回調査から317万3,571人減少した。過去最大の減少幅となり、少子高齢化による自然減が加速している。
都道府県別にみると、東京都以外の46道府県で人口が減った。生産年齢人口（15～64歳）は7,348万843人で14歳以下の人口は1,334万9,001人で、総人口に占める割合は10.9％だった。65歳以上は3,614万1,613人で、総人口に占める割合は29.4％に上り、諸外国と比べ最も高い。外国人の人口は39.8％増え、総人口の3.1％を占めている。

厚生労働省は９月29日、2026年の労働経済の分析（労働経済白書）を公表した。これによると、日本企業の生成AI（人工知能）の利用率は9.2％で、経済協力開発機構（OECD）加盟国平均の20.2％の半分未満にとどまると指摘している。
OECDのデータベース各国の従業員10人以上の企業の状況を集計した。個人の直近３カ月の利用割合も日本は26.7％とOECD平均の36.8％を大きく下回っている。

東京大学は９月28日、藤井輝夫学長の任期満了に伴う学長選考会議を開き、藤垣裕子教授を第32代学長に選出した。任期は2027年４月から６年間。女性の学長は東大で初となる。

愛知・名古屋アジア大会は９月28日、陸上男子3000ｍ障害で三浦龍司が８分17秒36の大会新で優勝し、青木涼真が０秒24差で２位に入った。男子400ｍ障害で後藤大樹はゴール直前でカタールの選手に抜かれ、惜しくも47秒93で２位だった。今大会３種目目の田中希美は、女子5000ｍで15分11秒65で２位だった。３種目ともメダルを獲得した。

公正取引委員会は、マンション管理組合が発注する大規模修繕工事を巡り、設計コンサルタント会社と修繕工事会社んぉ計42社の談合行為認定した、
本来、住民側に立つべき設計コンサルタント会社が、裏で工事会社と数十年にわたり癒着していた実態が明らかになった。こうした事態を受け、割高な修繕費を払わされていたマンション住民らは憤りの声をあげている。

脚本家、倉本聰（くらもと・そう、本名・山谷馨＝やまや・かおる）さんが９月18日、多臓器不全のため亡くなった。91歳だった。
倉本さんは会社勤務の後、フリーの脚本家としてデビュー。大河ドラマ「勝海舟」の脚本を手掛けたが、途中降板。「前略おふくろ様」などで人気を博した。だが、脚本家としてその地位を確立したのは1977年に北海道富良野市に移住してから。富良野市に拠点を置き、「富良野塾」を開設。テレビドラマや舞台に向け様々な脚本を世に送り出した。
北海道の大自然を舞台にした家族のドラマ、名作「北の国から」シリーズは同氏の代表作となった。富良野では脚本家や俳優を目指す塾生の育成にも取り組んだ。脚本家としてはテレビドラマで最後の代表作となったのが、2017年９月まで放送された「やすらぎの郷」。同作品では、多くの著名俳優・芸能人をキャスティングし、シニア世代の生きざまを描き話題となった。

日本相撲協会は９月27日、同日千秋楽だった秋場所で15日間の懸賞総数が3,688本となり、１場所の最多記録を更新したと発表した。今年夏場所の3,563本を125本上回った。秋場所Ⅰ日分の掲出最多初日の304本。懸賞は15日間すべて200本以上を記録した。

女子ゴルフの西村優菜（26）が９月27日、米アーカンソー州ロジャーズのピナクルCC（パー71）で行われたアーカンソー選手権で、米ツアー初優勝を飾った。通算21アンダー。初日から単独首位を譲らない完全優勝だった。２位に５打差つけた。
西村は大阪府出身。通算６勝。2023年から米国を主戦場としている。

愛知・名古屋アジア大会は９月27日、女子100mハードル、男子110mハードル、女子やり投げの決勝、男子マラソン競歩、十種競技などが行われた。女子100mハードルで福部真子、中島ひとみがワンツーフィニッシュを決め金・銀メダルに輝いた。男子マラソン競歩で勝木隼人が３時間３分36秒で金メダル、十種競技の丸山優真は8,123点で金メダルをそれぞれ獲得。女子やり投げで北口榛花は62ｍ70で銀メダルだった。男子110mハードルの村竹ラシッドも13秒29で銀メダルだった。